Кокцидиидозы вызываются простейшими из семейства эймериид, объединяющего подсемейства эймериид и изоспорин. В первое подсемейство входит род эймериа, во второе — изоспора, токсоплазма и др. Многие болезни этой группы принято называть по родовому названию кокцидиид: эймериоз, изоспороз, токсоплазмоз и т. д. Из их возбудителей наиболее патогенны кокцидииды рода эймериа.

Кокцидиидозы регистрируются на всех континентах. Они обусловливают высокую смертность животных и птицы (ягнят — 90%, кроликов — 85%, цыплят — до 100%).